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Ao saber que ex-membros da aliança Azur Lane, Sakura Empire e Iron Blood estão prontas para a guerra, forças da atual Azur Lane, Eagle Union e Royal Navy se reúnem em uma base avançada.

A base da Azur Lane foi atingida com força quando o Império Sakura atacou repentinamente. Enquanto as forças da Marinha Real e da Eagle Union lutam para concluir os reparos, a Red Axis prepara outro ataque, desta vez contra forças em mar aberto.

A chegada de Belfast, servos da Marinha Real, força a Red Axis a se retirar. Não há dúvida de que a Enterprise é a chave para o sucesso da aliança Azur Lane, mas também está claro que seus problemas são mais graves do que simples danos ao casco.

Após o ataque bem-sucedido contra as forças de Azur Lane, a frota da Red Axis retorna ao Império Sakura. Akagi verifica o andamento de seus grandes planos, e Ayanami se reúne com seus colegas e reflete sobre as batalhas que acabou de travar.

Sheffield e Edimburgo abrigam-se em uma pequena ilha para fugir da frota do Red Axis que os persegue enquanto aguardam reforços. Um grande confronto parece inevitável, mas os membros de ambos os lados da luta têm dúvidas e preocupações.

A missão de resgate é um sucesso, permitindo que Azur Lane aprenda sobre o Cubo Negro de Akagi. Ambas as alianças se reagrupam em suas respectivas bases para planejar seus próximos passos, enquanto descansam um pouco.

As forças de Azur Lane avançam para o mar aberto para enfrentar o Red Axis. Sob o comando de Akagi, a marinha do Império Sakura se reúne para encontrá-los. Enquanto Observer assiste do lado de fora da batalha, as duas forças colidem de frente.

Com Kaga e Akagi derrotadas, as forças do Império Sakura ficam desorganizadas. Enterprise, depois de ativar um poder misterioso e avassalador, também desaparece. Ambas as forças lutam para se reagrupar e pôr fim a esta batalha.

Ayanami salva Zuikaku e Shoukaku do ataque implacável da Enterprise, mas fica ferido. Ela recupera a consciência na base Azur Lane como prisioneira de guerra.

A Enterprise é assombrada pela visão recorrente do pesadelo e incapaz de lutar. Akagi está desaparecida, presumivelmente morta. Sem suas bandeiras, nem Azur Lane ou a Red Axis são capazes de agir. As Sirens estão determinadas a mudar isso.

Kaga lança um ataque contra seu próprio acampamento para revelar Orochi e une forças com Sirens. Eles lançam uma arma de destruição em massa, forçando a Azur Lane a reagir. A frota do Red Axis se reagrupa para perseguir Orochi.

O Orochi prova ser muito mais poderoso do que as tecnologias mais avançadas que a humanidade tem para oferecer, e a Enterprise é nocauteada por uma enorme explosão. A batalha está em sua fase final, à medida que cada combatente enfrenta as verdades que procura através da batalha.