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No meio das férias de verão, 36 alunos, alguns com superpoderes recém-descobertos, encontram-se sozinhos na escola, à deriva em um vazio negro, incapazes de entrar em contato com o mundo exterior. Alguns alunos tentam impor a ordem, mas enfrentam oposição.

Os alunos se mudaram para uma ilha próxima, onde há comida de sobra e podem conseguir o que quiserem através do poder de Mizuho. Mas, de repente, incêndios inexplicáveis ​​começam a surgir e os alunos partem para descobrir quem está os causando.

Nagara, Nozomi, Asakaze e Rajdhani continuam em busca de novos mundos. Os alunos começam a desaparecer e seus corpos são encontrados "paralisados" em conchas pretas, então Pony pede a Mizuho para investigar o assunto. Mizuho revela uma surpresa sobre seu poder para Nagara.

Enquanto os náufragos nadam em um misterioso poço, eles parecem ser momentaneamente levados de volta para casa. Cap convida Nagara para praticar beisebol com ele para contar a história da Liga Macaco, e como seu arremessador estrela, Azulão, perdeu um jogo perfeito.

Nagara e amigos usam seus poderes para procurar por novos mundos em um esforço para voltar para casa. Enquanto isso, os outros alunos discutem a bomba da Sra. Aki, que alguns alunos foram capazes de usar seus poderes de antemão e pode ser isso que os tenha deixado à deriva.

Nagara e Rajdhani chegam em um mundo chamado "Cineasta" e descobrem um filme gravado inteiramente a partir do ponto de vista de Nagara. Mizuho descobre um cachorro perdido de nome Yamabiko, que afirma ser outro náufrago que frequentou a mesma escola que os outros alunos.

Tendo aprendido a verdade sobre Este Mundo, grupos liderados pela Sra. Aki e por Hoshi se preparam para seguir caminhos separados. Nagara se encontra em um mundo de cabeça para baixo do qual não pode sair livremente e é forçado a trabalhar na construção de uma Torre de Babel que se estende para baixo.

Enquanto viaja pelo deserto, Mizuho pergunta a Yamabiko como ele se tornou um cachorro. Yamabiko então relata como, há cinco mil anos, ele vagava por diferentes mundos sozinho, até encontrar uma garota a quem ele gradualmente abriu seu coração. Mas a felicidade deles durou pouco.

Em um vasto deserto congelado, os gêmeos Sou e Seiji lutam entre si há milênios. A Sra. Aki diz que para mudar o mundo, eles precisam do poder "Reverter" dos gêmeos e Nagara e Mizuho vêm ajudar. Yamabiko interroga Sakura, uma das gatas de Mizuho.

Kossetsu lê as mentes de outras pessoas que passam em um mundo de estação de trem, usando seu verdadeiro poder. Ela é apaixonada por Asakaze, mesmo sabendo que ele está interessado por Nozomi, e que Nozomi é a única que pode mudá-lo. Enquanto isso, Asakaze recebe uma missão para mudar o mundo.

Depois de saber da morte de Nozomi pela carta de Kossetsu, Nagara e Mizuho realizam uma cerimônia em sua homenagem. Enquanto avançam no projeto para voltar para casa, são visitados por um velho amigo, que lhes conta a história de quando conheceu o homem que inventou a morte.

Nagara comparece à cerimônia de abertura de sua escola técnica, mas se sente deslocado. Ele vê Mizuho deixando sua escola só para meninas, mas ela o ignora. Ele se lembra do que aconteceu depois de decolar no espaço, questionando se ele realmente ficou à deriva.