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1213年，位于伊朗东部的城市图斯。失去母亲、远离故乡的幼女希塔拉，被一位学者家庭的善良主妇法蒂玛收留。起初，希塔拉因想回到故乡而抗拒学习，甚至想要逃跑。但在法蒂玛的儿子——立志成为学者的穆罕默德教导下，她明白了“只要你读书变聪明，不管遇到什么困扰，你都会知道该怎么做才是最好的”，从而逐渐认识到学习的重要性……

穆罕默德离开故乡八年后，蒙古帝国四皇子拖雷率领军队入侵了希塔拉等人居住的城市图斯。拖雷突袭宅邸，夺走了法蒂玛珍藏的抄本《几何原本》，并烧毁全城。希塔拉被蒙古军俘虏，陷入绝望深渊。此时，担任蒙古军翻译的少年西拉找到了她。

为了能出人头地，西拉想将有学识的希塔拉引荐给托雷。希塔拉得知《几何原本》被夺、法蒂玛被杀的真相后，意识到夺回珍贵的《几何原本》，才是自己唯一能做的事。这同时也是点燃向夺走自己一切的蒙古帝国复仇的狼烟。希塔拉觐见托雷时，自称“法蒂玛”。

在托雷的正妃唆鲁禾帖尼身边担任《几何原本》指导者的希塔拉，内心怀着强烈的憎恨，表面却装作顺从的近侍，伺机而动。数年之后，她终于完全赢得了唆鲁禾帖尼的信任。此时，皇帝成吉思汗驾崩了。随着政局发生巨大变动，一道出乎希塔拉意料的命令下达了。

希塔拉受唆鲁禾帖尼之命担任密探，潜入刺探可能挑拨关系的二皇子察合台的动向。在西拉的协助下，她顺利做好了准备工作。然而就在此时，因偶然获得的“札达石”，被三皇子窝阔台的六皇妃脱列哥那怀疑盗窃，受到调查。

脱列哥那相信了对蒙古帝国怀有仇恨的希塔拉，开始讲述自己悲伤的过往。时光回溯到25年前，脱列哥那嫁给年龄相差悬殊的篾儿乞族族长之一答亦儿兀孙为妻，她与兀孙的女儿忽兰等人建立了深厚的感情。然而，平静的日子转瞬即逝，成吉思汗率领蒙古族发动突袭，兀孙不得不做出一个决定。

希塔拉与脱列哥那结盟，誓要掀起一场复仇的风暴，向蒙古帝国讨回公道。脱列哥那利用自己作为蒙古皇帝（大可汗）窝阔台妻子的身份，参加总会议收集情报。希塔拉从脱列哥那处得知新的作战计划后，密谋在拥有最高权威的窝阔台和最大军力的拖雷之间制造矛盾。

因识字受到赏识协助书记官工作的希塔拉，在窝阔台的四皇妃木哥的引荐下，觐见了大皇妃（大可敦）孛剌合真。看到病榻上的孛剌合真，希塔拉运用所学的知识，准确推断出了病因和治疗方法，从而成功赢得了她的信任。随后，她开始在幕后推动一项旨在分裂蒙古帝国的计划。

蒙古帝国与金国开战。面对十五万敌军，托雷率领的蒙古军虽仅有四万人，却凭借“围猎战术”大获全胜。蒙古帝国借此进一步扩张领土，日益强盛繁荣。就在此时，脱列哥那却突然开始回避希塔拉，某天夜里甚至下令：“别到我的穹庐来。”察觉异常的希塔拉悄悄前去探查，然而……

在为突然病倒的窝阔台祈祷康复后，如同替身一般，托雷遭遇了意想不到的变故。当帝国的军力、权威和知识都集于窝阔台家之际，为了履行与脱列哥那所立的誓言，希塔拉不得不四处奔走，试图解救因孛剌合真的阴谋而陷入绝境的她。

孛剌合真的过去逐渐浮出水面。她得到了一种能因应处理方式不同成为良药或剧毒的石头，并以自身为实验对象研究其效果——一切只为消除丈夫窝阔台的威胁。而如今，希塔拉为了救助因孛剌合真的阴谋而陷入绝境的脱列哥那四处奔走，途中遇到了脱列哥那与窝阔台的儿子贵由。

唆鲁禾帖尼被希塔拉打动，拒绝了与贵由的政治联姻，并巧妙地化解了提议者孛剌合真彻底掌控拖雷家的算计。另一方面，一直寻找脱列哥那下落的希塔拉终于找到了线索——就在此时，窝阔台却突然召见希塔拉，向她提出比一场胜负。