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拥有玛那这一能力的贵族，肩负着保护人类的使命。身为就读于能力者培养学校的贵族，没有玛那的特例少女梅莉达·安杰尔。为了发掘出她的才能，库法·梵皮尔作为家庭教师被派到她的身边。肩负着“倘若确认她没有才能，就暗杀掉”这一任务的库法，打算对她下达残酷的处决……

终于拥有了玛那的梅莉达，经过与库法严酷的训练后，决定参加圣弗立戴斯威德女子学院所举办的公开比赛。然后，她终于有了一直在欺负着梅莉达的“斗士”阶级的涅尔娃·马尔堤吕比赛的机会……

在库法不在的情况下，梅莉达因周末举办的盛装晚会而心情高涨。与此同时，爱丽丝由于被要求穿上自己不太喜欢的衣服而心情低落。就在这时。为了绑架这两人的蓝坎斯洛普恐怖集团“黎明戏兵团”的威廉·金的魔爪悄悄向她们靠近……

梅莉达和爱丽丝在绑架事件后变得更加亲密。与姐妹学校圣德特立修女子学院的联合举办的月光女神选拔赛即将开始了。按照惯例各校都会推举一些比较优秀的高年级学生参加比赛，而圣弗立戴斯威德女子学院方面却选拔了让人意想不到的参赛者……

库法和萝赛蒂因暗杀者布拉克·马迪雅的出现而向学院提出中止月光女神选拔赛。然而，这一提案却被驳回，梅莉达和爱丽丝之间也在闹别扭的状态下地度过了选拔战的期间。于是到了选拔最后一天，4组选拔者之间的争霸战即将拉开帷幕……

在月光女神选拔战中，也有学院举办的后夜祭。圣弗立戴斯威德女子学院和圣德特立修女子学院的学生们聚集在一起，梅莉达和爱丽丝也享受着这一活动。在夜间派对的进行中，缪尔讲述了关于“灰色魔女”的怪异故事，而会场突然灯火熄灭一片黑暗。伴随着深红火焰的照耀下出现的，竟然就是传说的“灰色魔女”……

梅莉达和库法在圣弗立戴斯威德女子学院的研修旅行中即将前往的地点是乡哥尔塔。乡哥尔塔是萝赛蒂的故乡。她的父亲布洛萨姆也先行来到学院。为了让父母解除自己的婚约，萝赛蒂让库法假冒自己的结婚对象。而后在中堂大厅里一名学生突然被袭击了……

在乡哥尔塔的教堂里，神秘人物用和在圣弗立戴斯威德女子学院发生的事件一样的手段袭击了学生们。在有犯罪嫌疑的库法还没有被找到的情况下，梅莉达和马迪雅开始展开调查，而后在街上人们的打听下，她们朝着一座颇有幽森氛围的大宅走去……

7年前，乡哥尔塔的建筑物坍塌，遭受了一场大火灾。教堂里很多孩子因此死去，大蜘蛛纳克亚把孩子们作为自己的主食。惨剧中的布洛萨姆看到一个已经死去的那孩子站了起来。他的头发颜色渐渐变白……

圣弗立戴斯威德女子学院迎来了毕布利亚哥德司书官认定考试的季节。按照惯例一年级学生没有参赛资格，但是梅莉达和爱丽丝在学院的推荐下可以参加比赛。与此同时，对梅莉达持有怀疑态度的赛尔裘·席克萨尔等人，打算公布她的出身。

梅莉达和爱丽丝在毕布利亚哥德的考试中，与缪尔和莎拉夏同行。认定考试的内容是书的“修理”和“整顿”。一行人一边驱除啃食书籍的魔物“食虫”，一边在缪尔的协助下进行整顿。就在一行人马上就要得到合格的证明的时候……

在沃尔塔的幻想谭中，赛尔裘·席克萨尔开始了对梅莉达·安杰尔的审判。武士的位阶也被揭发，即使被追问玛那出现的原因，梅莉达也宣言自己作为安杰尔家子女的“矜持”。就在这时出现在她面前的敌人是……