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El cielo rojo siembra el pánico en la sociedad. Erica intenta subir a la nave para hablar con Anna con una herida que le han hecho a Tyler en la cabeza como excusa. Anna termina haciendo un comunicado público a través de la pantalla de su nave diciendo que la lluvia roja hará fértiles las tierras, revertirá el cambio climático, y beneficiará al planeta en general. Después de esto, la Quinta Columna investiga al respecto y descubre que la lluvia roja es en realidad un compuesto con altos niveles de fósforo.

Anna y Diana se enfrentaran en las oscuras entrañas de la Nave Nodriza. Diana ha estado allí durante 15 años y no tenia una visión única de Anna. Mientras tanto, Erica consigue analizar sangre de Tyler y descubre que los Visitantes le hicieron algo siniestro cuando estaba embarazada de él.

Erica se entera de que su pareja, Malik, es un visitante y debe luchar por su vida, para evitar que Anna descubra que pertenece a la Quinta Columna. Mientras tanto, Ana se entera de que Malik a desaparecido y ordena a Ryan que lo busque, mientras que Lisa se da cuenta de que su cuerpo está comenzando a cambiar, haciendo que cada vez se parezca más a su madre.

Después de que la facción radical la "Quinta Columna" asesinara a tres Embajadores de la Paz, Erica va en una misión para capturar a su líder, Eli Cohn, un ex agente del Mossad. Mientras tanto, como Jack y otros sacerdotes de todo el mundo empiezan a hablar en contra de los Visitantes, Anna se dirige al Vaticano en un esfuerzo por convencer a los líderes de la religión organizada que los visitantes son de verdad "en paz".

Anna usa su último regalo a la humanidad, "Concordia", como una distracción para ocultar una flota invasora de incubadoras que se utilizarán para asegurar la perpetuación de futuras generaciones de los visitantes. Mientras tanto, Eli Cohn (estrella invitada Oded Fehr) trata de convencer a Erica y la Quinta Columna de que la gala de "Concordia" es el momento perfecto para asesinar a Anna.

Anna, enfurecida por la creciente audacia de los ataques de la Quinta Columna, recluta a Ryan en un intento de acabar con la Quinta Columna de un solo golpe. Mientras tanto, el padre Travis, siguiendo las órdenes del Vaticano, pide a Jack que abandone la iglesia, y Lisa conoce a Diana, su abuela - la cual Anna dijo que estaba muerta - por primera vez.

Erica trata de que los antiguos tenientes de Cohn le apoyen como nueva líder de la Quinta columna mientras busca a la doctora que le atendió mientras estaba embarazada de Tyler, ya que parece estar implicada en más casos similares. Mientras, Anna descubre que Tyler no está preparado para reproducirse con Lisa y se plantea probar con otro joven, lo que volvería a Tyler totalmente prescindible.

Mientras ultima los preparativos para la inseminación de Lisa, todos los candidatos de Anna empiezan a morir en todo el mundo. Es el momento de terminar de recoger el adn de los aspirantes a vivir a bordo, lo cual brinda a la Quinta columna la posibilidad de identificar a un candidato de cada ciudad para insertarles un virus que infecte todo el adn recogido por los vivitantes. Erica está dispuesta a cualquier cosa con tal de acabar con los planes de Anna, pero Jack no comparte la actitud de su nueva jefa.

Sid descubre que oculto en el proyecto Concordia se haya lo que parece ser una cadena de sistemas de aterrizaje para naves visitantes. Erica decide sabotear uno de los reactores de energia azul para que la opinión pública se vuelva contra el plan de Anna. Mientras, un acercamiento de Tyler a su madre es tomado por Anna como un paso atrás en sus intenciones, por lo que trata de aplicar su éxtasis en humanos para controlar sus emociones. Por otro lado, Diana comienza a tratar de parar los pasos de su hija dando instrucciones a Lisa, pero además tratando de ganarse la confianza de Marcus.

El tiempo corre y el plan para derrocar a Anna se torna inminente. La única forma de sacar a Anna de la nave nodriza es fingir el secuestro de Lisa a cambio de la propia Anna, momento en que Diana saldrá de su cautiverio para alzarse como la reina que nunca debió dejar de ser. Un plan perfecto si no subestimara la inteligencia de Anna.