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Después de presenciar el suicidio de su hermana, Kakeru vive el resto de su infancia en un orfanato, donde conoce a una joven llamada Yuka. Años más tarde, nos encontramos con Kakeru, ahora un adolescente, asistiendo a la escuela secundaria con Yuka. Los días ordinarios que han llegado a esperar se vuelcan cuando son arrojados a un mundo alternativo al que llaman "Red Night".

Kakeru y Yuka se lanzan de nuevo en la dimensión de la Noche Roja de nuevo. Esta vez se encuentran con un fuerte joven llamada Misuzu Kusakabe, que los salva de una horda de criaturas-blob como malos, y encontrar una chica que está atrapado dentro de un cristal. Los tres son atacados por algunos adversarios mucho más fuertes, pero una vez más se encuentran volver al mundo normal.

Kakeru, queriendo proteger a Yuka, pide a Misuzu si ella le enseñará cómo usar una espada. Misuzu se niega. pero Kakeru está decidido a aprender para que pueda proteger a Yuka la próxima vez que se llevan a la Noche Roja.

Kakeru está decidido a encontrar su poder, pero parece que no puede despertarlo. Ellos se toman una vez más a la Noche Roja y son atacados por dos de los Caballeros Negros. Misuzu trata de combatir y contener un caballero negro pero no logra romper el impasse. Ella es salvado por Yukiko, que entra en la pelea muy cerca de dar un golpe de muerte a la oponente de Misuzu cuando es atravesado por la espalda por un segundo caballero negro.

Kakeru y Yuka se introducen primero en el mudo Kukuri, que es idéntico en apariencia y nombre a la hermana muerta de Kakeru. Kakeru reanuda su entrenamiento de espada con Misuzu en la escuela, poco después de que cae la Noche Roja. Durante la Noche Roja, Misuzu se dedica inmediatamente por un caballero negro, y Yuka y Kakeru están de nuevo obligados a escapar.

Kakeru se ha quedado atascado en un coma atormentado por el dolor y sus recuerdos del pasado. Sus amigos están a su lado, preocupado por su estado de salud. Misuzu intenta un ritual para él y gratuita Kakeru de su tormento sanar. El ojo de Aeon activa y el pasado y el presente se encuentran en una reunión de las mentes. A la mañana siguiente, Kakeru despierta curado, a un Misuzu debilitado que se desmayó en su regazo.

La Noche Roja ha caído y Yuka está tratando desesperadamente de correr y olvidar sus temores acerca de Kakeru y Misuzu. Los otros buscan en vano a Yuka, temiendo lo peor, y se separan para encontrarla. Kakeru y Takahisa buscan en la escuela, mientras que las chicas buscan en la ciudad. Mientras tanto, Lissette despierta para encontrarse sola y pone a prueba los límites de la barrera de cristal. Yukiko logra encontrar Yuka en un templo, hablando consigo misma acerca de Kakeru.

Los Caballeros Negros conversan sobre los fragmentos con Superbia comentando "No hay fuerza en este mundo, es más aterrador que la inocencia". Yuka despierta a la mañana siguiente para ver Kakeru dormitando en una silla junto a la cama. Él le pregunta si ella está bien y Yuka le asegura y declara sus deseos de protegerlo. Abajo, en la sala de estar Misuzu y Takahisa discuten el poder de Yuka, la Noche Roja y la razón por la que son perseguidos por ellos. Kakeru enfrenta a Kukuri sobre el libro de notas y le pide que deje a Yuka solo. Después Takahisa parte en busca de Yukiko, Misuzu comprueba la barrera oni alrededor de su casa, que muestra grietas finas.

Después de ver Saeko colgado por Superbia, Tajima entra en un ataque de rabia; exactamente lo que sus padres habían temido (el demonio de fuego, como él lo llama) Mientras tanto, Shiori informa a Kakeru que sólo él puede detener el demonio. Las cosas empiezan a despertar cuando Tajima está luchando contra un clon de Superbia, y al mismo tiempo Misuzu está luchando contra el verdadero Superbia.

Shiori viene y le dice a Kakeru y Misuzu todo acerca de la noche roja y de los caballeros negros. Lisette es en realidad Liselotte, quien busca destruir el mundo, al igual que su amante, Verard deseaba. 64 años antes, Liselotte fue sellado por Index. Sin embargo, al hacer esto, los discípulos se convirtieron en criaturas horribles quienes ahora se llaman los Caballeros Negros, quienes custodian el sello de Liselotte.

Liselotte despierta y procede a matar a Yuka y absorber su fragmento del vacío. Kakeru vio el flashback y trata de reflejar el poder, que no pudo. Su nulo fragmento fue absorbida por Liselotte y ganó el poder. Avaritia, con el fin de proteger los fragmentos restantes, se teletransportan Misuzu y Kakeru a la noche roja, mientras que Shiori se queda para luchar con Liselotte junto a Superbia y Avaritia (en su forma de dragón, Georgius.) Mientras tanto, Kakeru y Misuzu tratan de averiguar si Yuka sigue vivo y tratando de encontrar su camino de regreso a la noche roja.

Decididos a prevenir que esos eventos ocurran Kakeru decide suicidarse para evitar que Liselotte de tome su ojo. Después de apuñalarse a sí mismo, tiene un flashback y recuerda todos sus recuerdos de la infancia, en particular la forma en que Yuka siempre ha mirado hacia fuera para él. Para su sorpresa se ​​despierta en la enfermería.