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Amate Yuzuriha, une lycéenne qui habite sur la colonie Izuma, rencontre une passeuse, Nyaan.

Char, un pilote d’élite des forces de la Principauté de Zeon, capture le dernier mobile suit Gundam de la Fédération Terrienne, un élément clé de leur "Opération V", sur Side7. À partir de ce moment, le cours de la guerre change radicalement, menant finalement à la victoire de la Principauté de Zeon dans la Guerre d’Un An. Cependant, juste avant la fin de la guerre, le Gundam et Char…

Amate rencontre un garçon, Shuji, qui se révèle être le pilote du Gundam Rouge. Incapable d'oublier les lumières du cosmos qu'elle a vues avec lui, elle lui suggère de former une équipe de Mav et de disputer des Batailles de clans. Son pseudonyme de pilote sera... Machu.

La Sorcière, une unicum qui a abattu plus de cent ennemis durant la Guerre d'Un An, s'inscrit à la prochaine Bataille de clans pour régler ses comptes avec le Gundam Rouge. Être mère et épouse ne l'empêche pas de se lancer à corps perdu dans le combat face à Machu, médusée par la fatalité dont elle est témoin.

Grâce à ses gains aux Batailles de clans, Machu prévoit de gagner la Terre avec Shuji et Nyaan. Hélas, un jour de combat, elle est coincée par Xavier. Alors que son rêve de voir la Planète bleue pourrait connaître une fin prématurée, Nyaan prend une décision.

Annqi découvre la planque de Shuji. Des informations sur le Gundam Rouge valent plus cher qu'une prime de victoire aux Batailles de clans. Machu apprend qu'Annqi compte finaliser la transaction durant la prochaine Bataille. En parallèle, la direction du renseignement de la Fédération Terrienne a vent d'informations top secrètes sur Kycilia et s'apprête à passer à l'action...

En apprenant le plan d'Annqi, Machu élabore un plan avec Nyaan pour utiliser la Bataille de clans comme moyen d'aider Shuji à s'échapper. Cependant, leur adversaire dans la prochaine bataille s'avère être un mobile armor nouvellement construit et utilisé par des terroristes visant à assassiner Kycilia.

À la fin de la guerre d'un an, la flotte Sodon, dirigée par Char, s'est lancée dans l'opération des forces de la Fédération terrestre visant à larguer la forteresse de Salomon. Pour protéger la ville lunaire de Grenade. Cinq ans plus tard. À Grenade, Nyaan était présent avec Kycilia.

Guidée par un mystérieux message, Machu s'échappe de Sodon et descend sur Terre à bord du Sieg Axe. Après son atterrissage d'urgence, Machu est sauvée par une femme retenue prisonnière dans le manoir de Kabas et aimée comme sa « grande sœur ». Machu l'élimine et tente de s'échapper à bord du Core Fighter.

Afin de mettre un terme aux activités destructrices d'Iomagnusso, Machu tente de sauver la Fille Rose à la demande de Sharia Bull. Cependant, un pas devant lui, Gifred, personnage de Nyan et ayant reçu des ordres de Kycilia, tente d'activer le canon Zekunova. La cible est l'humanité entière sur Terre.

Machu, désireuse de secourir la Fille de la Rose, lance son GQuuuuuuX dans la bataille contre le GFreD de Nyaan. Peu après, guidée par Shuji, elle s'aventure au cœur du Yomagn'tho, où elle aperçoit Kycilia et Char.

C'est la lutte finale. Le Mobile Suit tout de blanc revêtu apparu depuis l'autre côté essaie d'attenter à la vie de Lalah. Comble de l'horreur, Shuji s'avère être aux commandes. Bien décidée à sauver Lalah, Machu forme un binôme de Mav avec Nyaan et se dresse sur la route de Shuji.