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La nouvelle vie parfaite du Dr. Daniel Pierce à Paris est soudainement bouleversée lorsque le FBI sollicite sa collaboration dans une affaire internationale périlleuse. Pendant ce temps, son assistant Max Lewicki et Dean Paul Haley complotent pour tenter de ramener Pierce à Chicago.

Un procureur tombe mystérieusement mort au milieu d’une salle d’audience. Immédiatement, Pierce et Moretti partent sur les traces du tueur. Pendant ce temps, Moretti et Donnie prennent une décision concernant leur avenir.

Une jeune victime avec un trouble du développement est prise en otage lors d’un vol de banque. Moretti amène Pierce pour interroger le garçon. Lorsque les coupables ont finalement été traqués, on découvre qu’il est question de bien plus que de l’argent. Pendant ce temps, Pierce reçoit l’étonnante visite de son père James, de qui il n’est pas très proche.

Moretti appelle Pierce pour examiner Elena Douglas, une femme qui a avoué un meurtre et prétend être possédée par le démon. Pendant ce temps, les choses se compliquent et mettent en péri les plans de mariage de Donnie et Moretti.

Lorsque le célèbre neuroscientifique Landon Jennings est retrouvé mort, Moretti et Pierce tentent de comprendre comment quelqu'un a pu avoir accès à son étude impénétrable pour le tuer. Lewicki se retrouve avec deux fois plus de travail quand James, le père de Pierce, emménage avec eux.

À la suite de l’enlèvement d’un enfant, Moretti traque le kidnappeur et fait une découverte très bizarre. Comme Pierce et Moretti enquêtent aussi en parallèle sur un assassinat, ils se rendent compte qu'il pourrait y avoir un autre enfant là-bas qui a besoin de leur aide. Pendant ce temps, Donnie et Moretti discutent de leur avenir ensemble et songent à l'achat d'une maison en banlieue.

Un propriétaire de galerie d’art meurt d’une étrange façon. Moretti est convaincu qu’il s’agit d’un meurtre. La recherche de l’assassin amène Moretti et Pierce sur la piste d’œuvres d’art volées. Alors que Pierce travaille sur ce cas, il se voit forcer de réexaminer sa relation avec Natalie.

Pierce est forcé de faire face à un cas qu’il n’a jamais été en mesure de résoudre, soit celui d’un agent du FBI retrouvé mort. Pierce accepte d’aider Moretti puisque le tueur court toujours. Cependant, son thérapeute, le Dr Rosenthal, croit que ça ne fera qu’exacerber l’état de Pierce.

Donnie et Moretti sont pris entre deux coups de feu quand un sniper tire dans le hall de l'édifice fédéral.

Donnie réclame l’aide de Pierce après s’être mis dans une situation compromettante. Alors que la preuve commence à s’accumuler contre Donnie, Pierce et Moretti ont des craintes et des doutes même s’ils travaillent fort pour résoudre l’affaire. Pendant le chaos, Pierce doit conjuguer avec son père qui a agressé quelqu’un dans un centre pour personnes âgées.

Le père de Daniel et son ami Dean Haley sont confrontés à la décision s’ils permettront ou non à Pierce de subir une chirurgie à haut risque pour sa blessure post-traumatique. Daniel travaille sur la résolution d'un autre cas d’assassinat.

Moretti part en mission d'infiltration pour enquêter sur les meurtres de propriétaires d’entreprises de viande. Pendant ce temps, Pierce songe à faire une confession personnelle à Moretti.

Pierce et Moretti découvrent un scandale d’ampleur international en enquêtant sur les meurtres d'un diplomate bangladais et un journaliste de Chicago. Distrait par le cas, Moretti doit conjuguer avec les préparatifs de son mariage avec Donnie et se tourne vers Pierce pour l'aider.

Un étudiant un peu excentrique est accusé d'avoir tué sa petite amie qui avait refusé de s'enfuir avec lui à l'étranger. Le croyant bipolaire ou schizophrène, mais non coupable, Pierce le fait interner auprès de Caroline Newsome le temps de l'innocenter. À deux jours du mariage de Kate et Donnie, Pierce doit travailler seul et faire face à ses sentiments pour son ancienne étudiante…

Kate a été enlevée le jour de son mariage pour être échangée contre Josiah Rosenthal, l'ex psychiatre de Pierce, en attente de son exécution. Avec le père de la mariée, Joe Moretti, Pierce et Donnie vont alors agir sans l'aide de la police…