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Rin, dopo l'addio di Yukio, decide che deve scoprire il segreto della loro nascita. Si imbarca in un viaggio di 40 anni nel passato con l'aiuto di Mefisto.

Shiro chiede a Mephisto di essere scelto come Exwire, alimentando il suo desiderio di uccidere i demoni. Mentre segue la sua crescita, Rin scopre la verità sull'Asylum e il Settore 13. Poi, dopo cinque anni dal loro primo incontro, Shiro incontra Yuri durante una missione contro un ent.

Shiro e Yuri proseguono le loro vite secondo ciò in cui credono. Yuri, però, riesce a vedere oltre le apparenze del comportamento di Shiro.

Yuri e gli scienziati della Sezione 13 assistono allo sviluppo di Satana, ora nel corpo adulto di Goro ma con lo stato mentale di un bambino.

Rinka, ora risvegliato come Satana, scappa e lascia Yuri e Shiro alle loro vite... per poi stravolgerle di nuovo dopo alcuni anni.

Yuri e Satana scappano dall'Asylum, ma vengono presto catturati. Al loro ritorno, scoprono che Yuri è incinta...

Shiemi viene portata al Vaticano non appena si riprende, mentre Rin si prepara a scoprire la verità sulla Notte Blu.

Ha inizio la Notte Blu. Mentre il primo neonato scaglia le sue fiamme blu contro i presenti e Yuri lotta per far nascere il secondo bambino...

Shiro è pronto a lottare per proteggere Yuri e i suoi bambini da Satana e dal mondo intero.

Con la morte del corpo di Satana da una parte e la morte di Yuri dall'altra, umani e demoni devono ora affrontare le conseguenze della Notte Blu...

Incaricato di prendersi cura di Rin e Yukio, Shiro comprende i propri limiti.

Rin conclude il suo viaggio nel passato... e ora deve prendere una decisione per il futuro.