전체 에피소드

서력 2040년의 혹성 '에덴'. 뉴 에즈워즈 기지에 최첨단 기종인 'YF-19'의 테스트 파일럿으로 발령을 받게된 '이사무'. 그러나 라이벌이자 또 다른 테스트 기종인 'YF-21'의 파일럿이 한 때 친구였지만 지금은 원수지간이 된 '가르도'라는 것을 알게 된다. 시제품의 정식 채용을 둘러싸고 벌어지는 경쟁하는 와중 두 사람의 오랜 친구 뮨이 행성 에덴에 오게 되는데...

신형 가변 전투기의 경쟁 테스트와 버츄얼 아이돌 가수인 샤론의 콘서트가 행성 에덴에서 개최 된 것으로, 이사무들의 인생은 크게 바뀌게되었다. 각자 기체를 몰고 충돌하는 이사무와 가르도. 그 두 사람에 사랑과 슬픔의 눈빛을 뮨. 그런 가운데 사이버 가수 샤론이 파문을 불러 일으키는데 ...

가르도의 책략으로 부상당한 이사무. 메디컬 룸에서 의식을 되찾은 그는 걱정듯한 뮨의 모습을 볼 수있었다. 그리고 그런 둘에게 멀어져 지구로 떠나는 뮨. 참을 수없는 생각에 초조해져가는 이사무들... 그 무렵, 지구 마크로스 정부에서는 무인 전투기 '고스트 X-9'의 개발이 끝나려하고 있었다 ...

「YF-19」을 탈취 한 이사무는 무인 발키리에게 복수하기 위해 지구를 향한다.. 그를 「YF-21」로 추격하는 가르도. 하지만 서로 장렬한 공중전을 전개하는 그들 앞에 왜곡 된 자아를 획득 한 샤론이 파견한 「고스트 X-9」이 나타나고 샤론은 마크로스 시티를 손에 넣고 시민들의 마음까지 조종하기 시작하는데....