Wszystkie odcinki

Ludzkość porzuciła Ziemię i w kosmosie toczy wojnę z tajemniczymi Hideauze. Podczas jednej z bitew młody pilot Ledo zostaje wyrzucony w nieznane, a po przebudzeniu odkrywa, że trafił na dawno zapomnianą, znów nadającą się do życia Ziemię i na ogromną flotę statków zwaną Gargantia.

Ledo, wciąż traktowany jak zagrożenie, próbuje nawiązać dialog z załogą Gargantii, a Chamber pomaga mu porozumieć się z mieszkańcami i poznać historię zalanej oceanem Ziemi. Gdy piraci atakują statki floty, Ledo rusza do walki, a jego bezwzględna siła ognia budzi w miejscowych przerażenie i nieufność.

Mieszkańcy Gargantii uświadamiają Ledo, że w ich świecie przemoc jest ostatecznością, a ludzie muszą polegać na sobie, by przeżyć. Kiedy jednak flota pirackiej „cesarzowej” Lukkage zagraża wszystkim, Ledo ponownie wsiada do Chambera, by obronić nowy dom i zyskać miejsce wśród załogi.

Ledo coraz bardziej wciąga się w zwyczajne życie na Gargantii, poznając doktora Oldhama i chorego Bebel, od których dowiaduje się, że powrót w kosmos może być praktycznie niemożliwy. Wyrzeźbiony przez niego flet i wspólne chwile z mieszkańcami budzą w nim dawno uśpione wspomnienia oraz pytania o własną przyszłość.

Podczas rzadkiego spokojnego dnia, gdy morze się uspokaja, załoga robi sobie przerwę od pracy i oddaje się zabawie. Ledo, wciąż nieumiejący znaleźć dla siebie zajęcia w tym świecie, zostaje wciągnięty przez Piniona i Amy w beztroski wypad na plażę, który po raz pierwszy pozwala mu naprawdę odpocząć.

W czasie festiwalu na Gargantii Ledo próbuje nowych zajęć – od połowów po prace przy wydobyciu – i stopniowo zbliża się do Amy, ucząc się jej zwyczajów. Gdy pod wodą pojawia się tajemnicze stworzenie przypominające jego wrogów z kosmosu, żołnierskie instynkty biorą górę i Ledo szykuje się do walki.

Ledo bez wahania zabija święte dla mieszkańców Ziemi kałamarnice, co wzbudza w flocie lęk przed nieszczęściem i groźbę konfliktu z innymi ludźmi. Kiedy przez okolice Gargantii przepływa całe ich stado, Ledo staje przed wyborem między rozkazami wyniszczania wroga a delikatną równowagą świata, który dopiero zaczyna rozumieć.

Śmierć dowódcy Fairlocka wstrząsa Gargantią, a nowa liderka Ridget musi zmierzyć się z buntem części floty chcącej odejść za Pinionem. Ledo, przekonany, że tylko on może ochronić Amy i Bebel przed zagrożeniem z głębin, wyrusza z Pinionem, zostawiając za sobą rozdartą i osłabioną Gargantię.

Ledo i Pinion atakują gniazdo kałamarnic, niszcząc kolejne stworzenia i ruiny dawnej cywilizacji w poszukiwaniu skarbów. Głęboko pod wodą Ledo odkrywa zapisy, które wywracają do góry nogami wszystko, co wiedział o wojnie ludzi z Hideauze, zmuszając go do zakwestionowania własnej roli żołnierza.

Na oczyszczonym z potworów terenie Pinion ogłasza własne królestwo złomu, przyciągając piratów i inne statki obietnicą skarbów dawnej technologii. Gdy do floty zbliża się tajemniczy, potężny okręt z maszyną podobną do Chambera oraz dobrze znanym dowódcą na pokładzie, Ledo staje przed widmem powrotu do militarnej rzeczywistości, od której próbował uciec.

Odnaleziony przez Ledo porucznik Kugel rządzi ogromną flotą jak bóg wojny, utrzymując ludzi żelazną dyscypliną i fanatyczną wiarą. Ledo i jego towarzysze zostają wciągnięci w tę militarystyczną społeczność, a kolejne rozkazy Kugela zapowiadają dramatyczne starcie z Gargantią.

Przerażony okrucieństwem floty Kugela, która bezlitośnie pozbywa się słabych, Ledo nie może dłużej ślepo wykonywać rozkazów i szykuje bunt wraz z Pinionem, Lukkage i innymi sojusznikami. Gdy Gargantia w pośpiechu przygotowuje się na nadciągający atak, dochodzi do decydującej konfrontacji między Ledo a jego dawnym dowódcą, odsłaniającej mroczną tajemnicę tej armii.

W obliczu szaleńczej idei Striker, która ogłasza się boskim przewodnikiem ludzkości, Ledo i Chamber decydują się ją powstrzymać, nawet za cenę własnego życia. W tym samym czasie Gargantia staje do największej bitwy w swojej historii, a wybory Ledo zadecydują o tym, czy znajdzie na Ziemi nowy dom.