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在整个哥谭市的目光都紧盯着鲁伯特·索恩庭审的同时，蝙蝠侠正在街头上奋力抵御索恩势力及其用枪成狂的副手埃德华·奈格玛，也就是谜语人的报复！

三联工业接连遭到大胆袭击，蝙蝠侠必须不惜一切追查并制服背后那个复仇心切的火箭专家，在无辜生命陷入险境之前将其绳之以法！然而，随着黑暗骑士侦探深入调查，一个又一个令人震惊的真相接连浮出水面！

随着鲁伯特·索恩失踪，其继任者埃德华·奈格玛 (谜语人) 在哥谭市兴风作浪，街头暴力和公然抢劫事件不断升级，警方资源已捉襟见肘，难以应对。为了掌握索恩的下落，并彻查新任老大奈格玛的背景，蝙蝠侠乔装成"火柴马龙"，潜入黑门监狱展开卧底行动！

一个惊现血色蝙蝠印记的凶案现场为蝙蝠侠带来了不少麻烦。哈蒂·泰奇掀起的舆论风暴让黑暗骑士侦探遭到了前所未有的公众质疑。为了洗清冤屈，蝙蝠侠顺藤摸瓜，发现了一个由极具蛊惑力的先知"疯狂修士"领导的狂热蝙蝠崇拜组织。

身败名裂的警探吉姆·科里根为求将功赎罪，自愿参与一项监狱实验。然而，实验结果却超出了所有人的想象，甚至连蝙蝠侠都感到前所未有的惊骇。

哥谭大学发生的一连串离奇学生死亡事件，迫使隐匿已久的哈莉·奎茵重新现身。当她的调查与蝙蝠侠不谋而合，这对昔日对手决定暂时结盟，共同对抗眼前的威胁--稻草人！

在枪杀了一名前警官后，"谜语人"埃迪·奈格玛与一位名叫"荆棘"的神秘女子结为搭档。这段充满犯罪气息的爱情故事将整个哥谭市搞得天翻地覆，迫使蝙蝠侠必须采取行动。

蝙蝠侠继续追查鲁伯特·索恩下落，却意外与一名自称"犯罪克星"的业余侦探凯莉·凯利的调查方向不谋而合！两人决定强强联手，共同对付哥谭市地下世界的幕后黑手，零度先生！

小丑公开宣判了杰索普市长的死刑。随着哥谭市陷入恐慌，哥谭警局紧急部署警力保护市长，而蝙蝠侠则在全力追捕小丑。他们的共同努力是否足以阻止这场迫在眉睫的灾难？

一场可怕的病毒席卷哥谭市，将市民们变成嗜血的杀人狂魔，整座城市迎来了审判之日。幸存者们在恐惧中瑟瑟发抖，蝙蝠侠的盟友们奋力挺身，竭力拯救每一个生还者。而黑暗骑士侦探，也终于迎来了与宿敌小丑的终极对决！